Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”

Departamento de Genética

LGN 215 - Genética

Mutação e poliploidia

Prof. Saulo Chaves

Piracicaba, São Paulo, Brasil

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Marcadores genéticos são marcos que indicam a existência de variações (polimorfismos) no DNA. Podem ser morfológicos ou moleculares, sendo estes, mais abundantes e eficientes em indicar variação

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Primeira Lei de Mendel, Segunda Lei de Mendel, extensões da segunda lei, genes ligados…

Conteúdo de hoje

  1. Mutação
    • Tipos de mutação
    • Origem e obtenção de mutantes
    • Sistema reparo
  2. Poliploidia
    • Origem e tipos de poliploides
    • Os poliploides e a agricultura

Mutação

Mutação

  • Mecanismo aleatório gerador de variação genética (novos alelos)
    • Uma das forças motrizes da evolução
  • Genética: estudo da variação hereditária
    • Dependente de mutação e recombinação
  • “A mutação gera novas cartas, a recombinação as embaralha e distribui”
    • Dinâmica fundamental no melhoramento

Mutação


Mutação

Mutação

Mutação

Locais de ocorrência de mutação

Somente mutações em células sexuais (germinativas) são herdáveis!

Tipos de mutação

Para guardar no coração

  • Mutação de ponto: alteração de um único par de bases do DNA ou de um pequeno número de pares de bases adjacentes
    • Substituição de bases
    • Inserções ou deleções
  • Alterações cromossômicas: alterações no número e/ou na estrutura de cromossomos, alterando o cariótipo do indivíduo
    • Estruturais: Deleção, duplicação, inversão, translocação
    • Numéricas: Euploidias e aneuploidias

Mutações de ponto

Mutações de ponto

O código genético é degenerado e possui códons de terminação

Mutações de ponto

O código genético é degenerado e possui códons de terminação

Mutações de ponto

  • Indels: mudanças na matriz de leitura (frameshift)

Mutações de ponto (consequências)

  • Mutações não-sinônimas em regiões codantes
    • Alteração nas proteínas resultantes
  • Mutações não-sinônimas em regiões não-codantes
    • Regiões reguladoras
    • Sítios de ligação de enzimas
    • Possível alteração nas proteínas resultantes

Mutações naturais ou espontâneas

  • Mutações de ocorrência natural que surgem aleatoriamente em todas as células
  • Erros na replicação do DNA
    • Erros de incorporação
    • Erros de replicação

Mutação natural ou espontânea

  • Deslizamento da fita durante a replicação

Mutação natural ou espontânea

  • Alinhamento defeituoso durante o crossing-over

Mutação natural ou espontânea

  • Depurinação: perda de uma base purina de um nucleotídeo
    • Lesão espontânea
    • Sítios apurínicos resultantes não conseguem especificar uma base complementar à original
    • Causa mais comum de mutação espontânea

Mutação natural ou espontânea

  • Desaminação \(\to\) perda de um grupo amino (NH2) de uma base
  • Lesão espontânea
  • Citosina \(\to\) Uracila \(\to\) Adenina

Mutação natural ou espontânea

  • Transposons: elementos transponíveis

Mutação induzida

  • Surgem por meio da ação de mutagênicos que aumentam as taxas de mutação em uma célula
  • Geração de mutação artificial: mutagênese
    • Substituição de uma base
    • Alteração da estrutura de uma base
    • Danificação de uma base
  • Pode ser utilizada para verificar a influência de um gene em um determinado no fenótipo
  • Aleatória

Mutação induzida

  • Substituição: agentes químicos análogos de bases

Mutação induzida

  • Alteração: malpareamento específico por alquilação, desaminação ou hidroxilação

Mutação induzida

  • Danificação: raios-X
    • Dano direto: expulsão de elétrons dos átomos \(\to\) quebra das ligações fosfodiéster \(\to\) quebra de fita simples
    • Dano indireto: radiação ionizante sobre a água produz espécies reativas de oxigênio \(\to\) alteração química das bases

Mutação induzida

  • Danificação: raios UV
    • Produção de fotoprodutos \(\to\) formação de dímeros

Sistemas de reparo do DNA

  • Os mecanismos indutores de mutações são suprimidos pelo sistema de reparo do DNA
  • A mutação é um evento raríssimo!
    • ~1 a cada 1 bilhão de nucleotídeos
  • A cada replicação, várias enzimas investigam as fitas da nova molécula em busca de erros
    • Fita molde vs Fita complementar, estrutura da dupla fita, presença de urofila, etc.

Sistemas de reparo do DNA

  • Revisão

Sistemas de reparo do DNA

  • Fotorreativação
  • Reparo por excisão

Sistemas de reparo do DNA

Taxa de erro na replicação (média)

Valores básicos em torno de 10−5. Com correção por revisão (proofreading) cai para 10−7. Usando o sistema de reparos de malpareamento (mismatch repair), incluindo pequenos loops causados por indels, cai para os valores observados de 10−9

Sistemas de reparo do DNA

  • Reparo da cadeia dupla
    • Correção das quebras bifilamentares (double-strand break)
    • Fenômeno frequente na meiose: crossing-over

Sistemas de reparo do DNA

  • Recombinação homóloga
  • Pareamento de filamento dependente de síntese
  • Uso da informação de outra molécula de DNA, em geral uma cromátide-irmã
  • Análogo ao que acontece durante o crossing-over

Sistemas de reparo do DNA

  • Junção de extremidades não-homóloga
  • Não há informações de homólogos disponíveis
  • Processo mais propenso à erros
    • Pares de base em ambos os lados da quebra podem ser perdidos
    • Pares de bases estranhos podem ser acrescentados

Sistemas de reparo do DNA

  • Manejo de danos

Mutações e a expectativa de vida

Mutações induzidas e a agricultura

  • Geração de variabilidade
  • Espécies com variabilidade restrita e/ou pecularidades em sua reprodução
    • Ex.: alho
  • Protocolo e mutagênico a depender da espécie e do objetivo
  • Mutant Variety Database
  • Centro de Energia Nuclear na Agricultura

Alterações cromossômicos

Alterações cromossômicas estruturais

Rearranjos cromossômicos provocados pela maioria dos fenômenos previamente descritos. Geralmente, causam síndromes

Alterações cromossômicas numéricas

Notação:


Código Significado
x número básico de cromossomos (ploidia)
n tipo celular (reprodutivas - n, somáticas - 2n, endosperma - 3n)

Diploides

Número somático é múltiplo exato do número básico (2n = 2x) \(\to\) conjunto básico de cromossomos é repetido duas vezes

Alterações cromossômicas numéricas

  • Aneuploidia: alteração do número de um ou alguns cromossomos
  1. Trissomia: 2n + 1, existe um cromossomo com uma cópia a mais
  2. Tetrassomia: 2n + 2, existe um cromossomo com duas cópias a mais
  3. Monossomia: 2n - 1, existe um cromossomo com uma cópia a menos
  4. Nulissomia: 2n - 2, o par de homólogos foi perdido

Alterações cromossômicas numéricas

Não-disjunção (segregação) dos cromossomos homólogos: principal causa da aneuploidia

Alterações cromossômicas numéricas

  • Euploidia: mudança no número de conjuntos cromossômicos, gerando indivíduos poliploides
  • Possuem um ou mais genomas repetidos várias vezes
  • Importante na evolução de plantas superiores
  • Características importantes para a agricultura
  • A maioria das espécies cultivadas já passaram por poliploidização

Alterações cromossômicas numéricas

Poliploidia

Mudança no número básico (ou usual, i.e., 2x) de conjuntos cromossômicos.

Poliploides

Autopoliploides: O conjunto cromossômico da mesma espécie é multiplicado
Espécies x 2n = ?x
Batata 12 48 (4x)
Campim-mombaça 8 32 (4x)
Batata doce 15 90 (6x)
Cana-de-açucar 10 80 (8x)
Caviar (silvestre) 30 240 (6x)
Alopoliploides: Uma espécie contém conjuntos cromossômicos de espécies distintas
Espécies x 2n = ?x
Tabaco 12 48 (4x)
Algodão 13 52 (4x)
Trigo 7 42
Café 11 44
Caviar (doméstico) 30 360

Poliploides

Complexidade na segregação

  • Altíssima heterogeneidade
    • Heterozigosidade
  • Maior dificuldade na fixação de alelos
  • Multialelismo

Efeitos da poliploidia

Exemplos na agricultura

Apanhado geral

Vimos hoje

Mutações são mecanismos aleatórios geradores de variação genética. “A mutação gera novas cartas, a recombinação as embaralha e distribui”

Vimos hoje

Mutações podem ocorrer em células somáticas ou germinativas. Podem, ainda, ser pontuais ou causar alterações estruturais em cromossomos inteiros. A quantidade, forma e posição das mutações ditará seus efeitos no organismo. O sistema de reparo do DNA impede com que as mutações tornem-se generalizadas no genoma.

Vimos hoje

A poliploidia é representada pela mudança no número básico (ou usual, i.e., 2x) de conjuntos cromossômicos. A maioria das plantas superiores já foram, em algum ponto de sua história evolutiva, poliploides. Algumas espécies de importância econômica ainda o são, e a poliploidização é uma ferramenta útil no manejo e melhoramento vegetal.

Material de apoio

Grato!