MUTAÇÃO E POLIPLOIDIA


Prof. Saulo Chaves

ESALQ / USP - Departamento de Genética

LGN 215 - Genética

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Marcadores genéticos são marcos que indicam a existência de variações (polimorfismos) no DNA. Podem ser morfológicos ou moleculares, sendo estes, mais abundantes e eficientes em indicar variação

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Conteúdo de hoje

  1. Mutação
    • Tipos de mutação
    • Origem e obtenção de mutantes
    • Sistema reparo
  2. Poliploidia
    • Origem e tipos de poliploides
    • Os poliploides e a agricultura

Mutação

Mutação

Mutação: mecanismo aleatório gerador de variação genética por meio de alterações na sequência de DNA de um gene. A mutação gera novas cartas, a recombinação as embaralha e distribui

Mutação e Seleção


Mutação e Seleção

Mutação

Domesticação de novo em tomateiro via edição gênica

Mutação

Características estudadadas por Mendel

Locais de ocorrência de mutação

Somente mutações em células sexuais (germinativas) são herdáveis!

Tipos de mutação

Mutação de ponto: alteração de um único par de bases do DNA ou de um pequeno número de pares de bases adjacentes

Alterações cromossômicas: alterações no número e/ou na estrutura de cromossomos, alterando o cariótipo do indivíduo

Mutações de ponto

Mutações de ponto

O código genético é degenerado e possui códons de terminação

Mutações de ponto

O código genético é degenerado e possui códons de terminação

Mutações de ponto

  • Indels: mudanças na matriz de leitura (frameshift)

Consequências

  • Mutações não-sinônimas em regiões codantes
    • Alteração nas proteínas resultantes
  • Mutações não-sinônimas em regiões não-codantes
    • Regiões reguladoras
    • Sítios de ligação de enzimas
    • Possível alteração nas proteínas resultantes

Mutações naturais ou espontâneas

  • Mutações de ocorrência natural que surgem aleatoriamente em todas as células
  • Erros na replicação do DNA
    • Erros de incorporação
    • Erros de replicação

Mutação natural ou espontânea

Deslizamento da fita durante a replicação:

Mutação natural ou espontânea

Alinhamento defeituoso durante o crossing-over:

Mutação natural ou espontânea

  • Depurinação: perda de uma base purina de um nucleotídeo
    • Sítios apurínicos resultantes não conseguem especificar uma base complementar à original
    • Causa mais comum de mutação espontânea

Mutação natural ou espontânea

  • Desaminação: perda de um grupo amino (NH2) de uma base
    • Citosina \(\to\) Uracila \(\to\) Adenina

Mutação natural ou espontânea

Elementos transponíveis

Mutação induzida

  • Surgem por meio da ação de mutagênicos que aumentam as taxas de mutação em uma célula
  • Geração de mutação artificial: mutagênese
    • Substituição de uma base
    • Alteração da estrutura de uma base
    • Danificação de uma base
  • Pode ser utilizada para verificar a influência de um gene em um determinado no fenótipo
  • Aleatória

Mutação induzida

Substituição: agentes químicos análogos de bases

Mutação induzida

Alteração: malpareamento específico por alquilação, desaminação ou hidroxilação

Mutação induzida

  • Danificação via raios-X
  • Dano direto: expulsão de elétrons dos átomos \(\to\) quebra das ligações fosfodiéster \(\to\) quebra de fita simples
  • Dano indireto: radiação ionizante sobre a água produz espécies reativas de oxigênio \(\to\) alteração química das bases

Mutação induzida

  • Danificação: raios UV
    • Produção de fotoprodutos \(\to\) formação de dímeros

Mutação induzida

Space farming Brasil

Sistemas de reparo do DNA

  • Os mecanismos indutores de mutações são suprimidos pelo sistema de reparo do DNA
  • A mutação é um evento raríssimo!
    • ~1 a cada 1 bilhão de nucleotídeos
  • A cada replicação, várias enzimas investigam as fitas da nova molécula em busca de erros
    • Fita molde vs Fita complementar, estrutura da dupla fita, presença de urofila, etc.

Sistemas de reparo do DNA

Revisão

Sistemas de reparo do DNA

Taxa de erro na replicação (média)

Valores básicos em torno de 10−5. Com correção por revisão (proofreading) cai para 10−7. Usando o sistema de reparos de malpareamento (mismatch repair), incluindo pequenos loops causados por indels, cai para os valores observados de 10−9

Sistemas de reparo do DNA

  • Reparo da cadeia dupla
    • Correção das quebras bifilamentares (double-strand break)
    • Fenômeno frequente na meiose: crossing-over

Sistemas de reparo do DNA

  • Recombinação homóloga
  • Pareamento de filamento dependente de síntese
  • Uso da informação de outra molécula de DNA, em geral uma cromátide-irmã
  • Análogo ao que acontece durante o crossing-over

Sistemas de reparo do DNA

  • Junção de extremidades não-homóloga
  • Não há informações de homólogos disponíveis
  • Processo mais propenso à erros
    • Pares de base em ambos os lados da quebra podem ser perdidos
    • Pares de bases estranhos podem ser acrescentados

Sistemas de reparo do DNA

Manejo de danos

Mutações e a expectativa de vida

Mutações induzidas e a agricultura

  • Geração de variabilidade
  • Espécies com variabilidade restrita e/ou pecularidades em sua reprodução
    • Ex.: alho
  • Protocolo e mutagênico a depender da espécie e do objetivo
  • Mutant Variety Database
  • Centro de Energia Nuclear na Agricultura

Alterações cromossômicos

Alterações cromossômicas estruturais

Rearranjos cromossômicos provocados pelos fenômenos previamente descritos. Geralmente, causam síndromes

Alterações cromossômicas numéricas

Notação:

Código Significado
x número básico de cromossomos (ploidia)
n tipo celular (reprodutivas - n, somáticas - 2n, endosperma - 3n)

Diploides

Número somático é múltiplo exato do número básico (2n = 2x) \(\to\) conjunto básico de cromossomos é repetido duas vezes

Alterações cromossômicas numéricas

Aneuploidia: alteração do número de um ou alguns cromossomos

  1. Trissomia: 2n + 1, existe um cromossomo com uma cópia a mais
  2. Tetrassomia: 2n + 2, existe um cromossomo com duas cópias a mais
  3. Monossomia: 2n - 1, existe um cromossomo com uma cópia a menos
  4. Nulissomia: 2n - 2, o par de homólogos foi perdido

Alterações cromossômicas numéricas

Não-disjunção (segregação) dos cromossomos homólogos: principal causa da aneuploidia

Alterações cromossômicas numéricas

Euploidia: mudança no número de conjuntos cromossômicos, gerando indivíduos poliploides

  • Possuem um ou mais genomas repetidos várias vezes
  • Importante na evolução de plantas superiores
  • Características importantes para a agricultura
  • A maioria das espécies cultivadas já passaram por poliploidização

Alterações cromossômicas numéricas

Exemplos na agricultura

Apanhado geral

Vimos hoje

Mutações são mecanismos aleatórios geradores de variação genética. “A mutação gera novas cartas, a recombinação as embaralha e distribui”

Vimos hoje

Mutações podem ocorrer em células somáticas ou germinativas. Podem, ainda, ser pontuais ou causar alterações estruturais em cromossomos inteiros. A quantidade, forma e posição das mutações ditará seus efeitos no organismo. O sistema de reparo do DNA impede com que as mutações tornem-se generalizadas no genoma.

Vimos hoje

A poliploidia é representada pela mudança no número básico (ou usual, i.e., 2x) de conjuntos cromossômicos. A maioria das plantas superiores já foram, em algum ponto de sua história evolutiva, poliploides. Algumas espécies de importância econômica ainda o são, e a poliploidização é uma ferramenta útil no manejo e melhoramento vegetal.

Para fixação

  1. Qual a importância da mutação para a genética e a evolução?
  2. Monte um diagrama com os principais tipos de mutação e suas diferenças, bem como os principais tipos de reparo realizados pelo aparato enzimático das células.
  3. Quais são os dois principais mecanismos para o reparo de quebras de fita dupla? Quais são suas diferenças?

Material de apoio